Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPZ6

THSD7A, Thrombospondin type-1 domain-containing protein 7A, humanhuman

Predictions only

Length 1,657 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THSD7AQ9UPZ6 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.81■■■■□ 3.48
THSD7AQ9UPZ6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC36.8■■■■□ 3.48
THSD7AQ9UPZ6 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.79■■■■□ 3.48
THSD7AQ9UPZ6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC36.77■■■■□ 3.48
THSD7AQ9UPZ6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.77■■■■□ 3.48
THSD7AQ9UPZ6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.76■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC36.74■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC36.72■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC36.71■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC36.7■■■■□ 3.47
THSD7AQ9UPZ6 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.69■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.66■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
THSD7AQ9UPZ6 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC36.62■■■■□ 3.45
THSD7AQ9UPZ6 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
THSD7AQ9UPZ6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
THSD7AQ9UPZ6 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
THSD7AQ9UPZ6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC36.58■■■■□ 3.45
THSD7AQ9UPZ6 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC36.53■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC36.52■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC36.51■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC36.51■■■■□ 3.44
THSD7AQ9UPZ6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC36.48■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.48■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC36.48■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC36.47■■■■□ 3.43
THSD7AQ9UPZ6 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.45■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC36.45■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
THSD7AQ9UPZ6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.38■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC36.34■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.41
THSD7AQ9UPZ6 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
THSD7AQ9UPZ6 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
THSD7AQ9UPZ6 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC36.29■■■■□ 3.4
THSD7AQ9UPZ6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.28■■■■□ 3.4
THSD7AQ9UPZ6 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.27■■■■□ 3.4
THSD7AQ9UPZ6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC36.26■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.24■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.24■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.23■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.23■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC36.23■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC36.23■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.39
THSD7AQ9UPZ6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC36.2■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC36.19■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.19■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.18■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC36.18■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC36.18■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC36.17■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC36.17■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.16■■■■□ 3.38
THSD7AQ9UPZ6 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.13■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC36.13■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.12■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC36.11■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC36.1■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.1■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.09■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.08■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.07■■■■□ 3.37
THSD7AQ9UPZ6 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC36.07■■■■□ 3.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms