Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPX0

IGSF9B, Protein turtle homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 1,349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IGSF9BQ9UPX0 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC30.49■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC30.48■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC30.47■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
IGSF9BQ9UPX0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.44■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC30.43■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
IGSF9BQ9UPX0 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
IGSF9BQ9UPX0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC30.3■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC30.26■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC30.26■■■□□ 2.44
IGSF9BQ9UPX0 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC30.25■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC30.24■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.2■■■□□ 2.43
IGSF9BQ9UPX0 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC30.2■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC30.15■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
IGSF9BQ9UPX0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC30.13■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.12■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC30.11■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.1■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC30.09■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC30.08■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.41
IGSF9BQ9UPX0 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.04■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
IGSF9BQ9UPX0 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC30■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.99■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC29.97■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
IGSF9BQ9UPX0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.95■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
IGSF9BQ9UPX0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.2 ms