Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP95

SLC12A4, Solute carrier family 12 member 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,085 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A4Q9UP95 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A4Q9UP95 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A4Q9UP95 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC12A4Q9UP95 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC12A4Q9UP95 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
SLC12A4Q9UP95 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
SLC12A4Q9UP95 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
SLC12A4Q9UP95 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.81■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A4Q9UP95 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
SLC12A4Q9UP95 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC12A4Q9UP95 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A4Q9UP95 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms