Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV0

MYO5B, Unconventional myosin-Vb, humanhuman

Predictions only

Length 1,848 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYO5BQ9ULV0 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.83■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
MYO5BQ9ULV0 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC39.81■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC39.8■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC39.8■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.79■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.79■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC39.79■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC39.78■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.78■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC39.77■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC39.77■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC39.77■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC39.76■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC39.76■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC39.76■■■■□ 3.96
MYO5BQ9ULV0 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
MYO5BQ9ULV0 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
MYO5BQ9ULV0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC39.7■■■■□ 3.95
MYO5BQ9ULV0 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC39.67■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC39.64■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC39.64■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC39.64■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC39.64■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.94
MYO5BQ9ULV0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
MYO5BQ9ULV0 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC39.63■■■■□ 3.93
MYO5BQ9ULV0 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC39.58■■■■□ 3.93
MYO5BQ9ULV0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYO5BQ9ULV0 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC39.57■■■■□ 3.93
MYO5BQ9ULV0 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.57■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.56■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC39.54■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.53■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.51■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.51■■■■□ 3.92
MYO5BQ9ULV0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYO5BQ9ULV0 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.49■■■■□ 3.91
MYO5BQ9ULV0 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC39.47■■■■□ 3.91
MYO5BQ9ULV0 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.45■■■■□ 3.91
MYO5BQ9ULV0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC39.44■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC39.42■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC39.42■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC39.41■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC39.4■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.39■■■■□ 3.9
MYO5BQ9ULV0 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC39.36■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.36■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC39.35■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.34■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC39.33■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.33■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC39.32■■■■□ 3.89
MYO5BQ9ULV0 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MYO5BQ9ULV0 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC39.28■■■■□ 3.88
MYO5BQ9ULV0 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.27■■■■□ 3.88
MYO5BQ9ULV0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC39.26■■■■□ 3.88
MYO5BQ9ULV0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC39.25■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.25■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.23■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC39.23■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC39.22■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.21■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC39.2■■■■□ 3.87
MYO5BQ9ULV0 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC39.19■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC39.19■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC39.18■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.18■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC39.17■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC39.17■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.16■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC39.15■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC39.14■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC39.14■■■■□ 3.86
MYO5BQ9ULV0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC39.12■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC39.12■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC39.11■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.1■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC39.1■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC39.1■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.09■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.08■■■■□ 3.85
MYO5BQ9ULV0 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC39.07■■■■□ 3.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.8 ms