Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULG1

INO80, DNA helicase INO80, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INO80Q9ULG1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC41.59■■■■■ 4.25
INO80Q9ULG1 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC41.58■■■■■ 4.25
INO80Q9ULG1 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
INO80Q9ULG1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.58■■■■■ 4.25
INO80Q9ULG1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC41.55■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC41.53■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC41.53■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC41.51■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC41.51■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC41.51■■■■■ 4.24
INO80Q9ULG1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC41.5■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.5■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC41.49■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC41.49■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.46■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC41.46■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC41.45■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC41.45■■■■■ 4.23
INO80Q9ULG1 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.44■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC41.43■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.41■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC41.41■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.4■■■■■ 4.22
INO80Q9ULG1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC41.37■■■■■ 4.21
INO80Q9ULG1 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.36■■■■■ 4.21
INO80Q9ULG1 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC41.35■■■■■ 4.21
INO80Q9ULG1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC41.34■■■■■ 4.21
INO80Q9ULG1 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.21
INO80Q9ULG1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.32■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC41.32■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC41.31■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.31■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC41.3■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.29■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.27■■■■■ 4.2
INO80Q9ULG1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC41.25■■■■■ 4.19
INO80Q9ULG1 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.24■■■■■ 4.19
INO80Q9ULG1 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC41.23■■■■■ 4.19
INO80Q9ULG1 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC41.2■■■■■ 4.19
INO80Q9ULG1 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC41.2■■■■■ 4.19
INO80Q9ULG1 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.19■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.18■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.17■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.15■■■■■ 4.18
INO80Q9ULG1 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.12■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC41.12■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC41.12■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC41.1■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.08■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.07■■■■■ 4.17
INO80Q9ULG1 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC41.07■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC41.05■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.05■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.04■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.03■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC41.01■■■■■ 4.16
INO80Q9ULG1 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC41.01■■■■■ 4.15
INO80Q9ULG1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.01■■■■■ 4.15
INO80Q9ULG1 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.99■■■■■ 4.15
INO80Q9ULG1 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC40.99■■■■■ 4.15
INO80Q9ULG1 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC40.95■■■■■ 4.15
INO80Q9ULG1 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 GRASP-206ENST00000552049 1688 ntTSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC40.92■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC40.9■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.89■■■■■ 4.14
INO80Q9ULG1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.88■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.87■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC40.87■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC40.86■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC40.86■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC40.85■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC40.83■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC40.83■■■■■ 4.13
INO80Q9ULG1 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC40.82■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.81■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC40.81■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC40.81■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC40.8■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC40.78■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC40.78■■■■■ 4.12
INO80Q9ULG1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.78■■■■■ 4.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms