Protein–RNA interactions for Protein: Q9UKS6

PACSIN3, Protein kinase C and casein kinase substrate in neurons protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PACSIN3Q9UKS6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
PACSIN3Q9UKS6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
PACSIN3Q9UKS6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
PACSIN3Q9UKS6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
PACSIN3Q9UKS6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
PACSIN3Q9UKS6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
PACSIN3Q9UKS6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.72
PACSIN3Q9UKS6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
PACSIN3Q9UKS6 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PACSIN3Q9UKS6 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.9 ms