Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK53

ING1, Inhibitor of growth protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ING1Q9UK53 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
ING1Q9UK53 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ING1Q9UK53 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
ING1Q9UK53 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ING1Q9UK53 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ING1Q9UK53 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
ING1Q9UK53 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ING1Q9UK53 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
ING1Q9UK53 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ING1Q9UK53 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms