Protein–RNA interactions for Protein: Q9UK11

ZNF223, Zinc finger protein 223, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF223Q9UK11 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF223Q9UK11 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF223Q9UK11 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF223Q9UK11 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ZNF223Q9UK11 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
ZNF223Q9UK11 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
ZNF223Q9UK11 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
ZNF223Q9UK11 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
ZNF223Q9UK11 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
ZNF223Q9UK11 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms