Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHW5

GPN3, GPN-loop GTPase 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN3Q9UHW5 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
GPN3Q9UHW5 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
GPN3Q9UHW5 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
GPN3Q9UHW5 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
GPN3Q9UHW5 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
GPN3Q9UHW5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
GPN3Q9UHW5 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
GPN3Q9UHW5 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
GPN3Q9UHW5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.6 ms