Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBX1

CTSF, Cathepsin F, humanhuman

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSFQ9UBX1 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CTSFQ9UBX1 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CTSFQ9UBX1 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CTSFQ9UBX1 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CTSFQ9UBX1 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
CTSFQ9UBX1 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
CTSFQ9UBX1 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
CTSFQ9UBX1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
CTSFQ9UBX1 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.1 ms