Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBK2

PPARGC1A, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGC1AQ9UBK2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
PPARGC1AQ9UBK2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC28.05■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PPARGC1AQ9UBK2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PPARGC1AQ9UBK2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PPARGC1AQ9UBK2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PPARGC1AQ9UBK2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
PPARGC1AQ9UBK2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PPARGC1AQ9UBK2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
PPARGC1AQ9UBK2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.63■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
PPARGC1AQ9UBK2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.2 ms