Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZM6

PKD2L2, Polycystic kidney disease 2-like 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKD2L2Q9NZM6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
PKD2L2Q9NZM6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PKD2L2Q9NZM6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
PKD2L2Q9NZM6 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
PKD2L2Q9NZM6 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
PKD2L2Q9NZM6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
PKD2L2Q9NZM6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
PKD2L2Q9NZM6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.8■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
PKD2L2Q9NZM6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.72■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
PKD2L2Q9NZM6 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.2 ms