Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZI2

KCNIP1, Kv channel-interacting protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNIP1Q9NZI2 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
KCNIP1Q9NZI2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC22.61■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
KCNIP1Q9NZI2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
KCNIP1Q9NZI2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
KCNIP1Q9NZI2 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
KCNIP1Q9NZI2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
KCNIP1Q9NZI2 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
KCNIP1Q9NZI2 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
KCNIP1Q9NZI2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.4 ms