Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX5

NPDC1, Neural proliferation differentiation and control protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPDC1Q9NQX5 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.51
NPDC1Q9NQX5 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
NPDC1Q9NQX5 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
NPDC1Q9NQX5 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
NPDC1Q9NQX5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
NPDC1Q9NQX5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NPDC1Q9NQX5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NPDC1Q9NQX5 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NPDC1Q9NQX5 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.5 ms