Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQX3

GPHN, Gephyrin, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPHNQ9NQX3 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.1■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC32.09■■■□□ 2.73
GPHNQ9NQX3 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.07■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC32.02■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.72
GPHNQ9NQX3 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
GPHNQ9NQX3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC31.9■■■□□ 2.7
GPHNQ9NQX3 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.88■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
GPHNQ9NQX3 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC31.79■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC31.77■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.68
GPHNQ9NQX3 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC31.75■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC31.73■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC31.72■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.71■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.7■■■□□ 2.67
GPHNQ9NQX3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC31.7■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.69■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
GPHNQ9NQX3 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC31.62■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC31.6■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.6■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.59■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
GPHNQ9NQX3 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
GPHNQ9NQX3 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC31.52■■■□□ 2.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.7 ms