Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP61

ARFGAP3, ADP-ribosylation factor GTPase-activating protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARFGAP3Q9NP61 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.72■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC28.7■■■□□ 2.19
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
ARFGAP3Q9NP61 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
ARFGAP3Q9NP61 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.56■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
ARFGAP3Q9NP61 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
ARFGAP3Q9NP61 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC28.42■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
ARFGAP3Q9NP61 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
ARFGAP3Q9NP61 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
ARFGAP3Q9NP61 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 110.9 ms