Protein–RNA interactions for Protein: Q9NP59

SLC40A1, Solute carrier family 40 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC40A1Q9NP59 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC27.53■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SLC40A1Q9NP59 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC40A1Q9NP59 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC40A1Q9NP59 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC40A1Q9NP59 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SLC40A1Q9NP59 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC40A1Q9NP59 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC40A1Q9NP59 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC40A1Q9NP59 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC27.27■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC40A1Q9NP59 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC40A1Q9NP59 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC27.2■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SLC40A1Q9NP59 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
SLC40A1Q9NP59 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
SLC40A1Q9NP59 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SLC40A1Q9NP59 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms