Protein–RNA interactions for Protein: Q9HCN4

GPN1, GPN-loop GTPase 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPN1Q9HCN4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GPN1Q9HCN4 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
GPN1Q9HCN4 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
GPN1Q9HCN4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
GPN1Q9HCN4 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
GPN1Q9HCN4 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GPN1Q9HCN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.23
GPN1Q9HCN4 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.2 ms