Protein–RNA interactions for Protein: Q9H2J4

PDCL3, Phosducin-like protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCL3Q9H2J4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.01■■■□□ 2.4
PDCL3Q9H2J4 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.97■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.96■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.39
PDCL3Q9H2J4 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC29.92■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 SH3GL1-202ENST00000417295 1404 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC29.91■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.9■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PDCL3Q9H2J4 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC29.85■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
PDCL3Q9H2J4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC29.81■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
PDCL3Q9H2J4 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PDCL3Q9H2J4 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC29.68■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC29.66■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PDCL3Q9H2J4 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC29.6■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.59■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.58■■■□□ 2.33
PDCL3Q9H2J4 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.56■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC29.54■■■□□ 2.32
PDCL3Q9H2J4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC29.54■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms