Protein–RNA interactions for Protein: Q9H0W9

C11orf54, Ester hydrolase C11orf54, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C11orf54Q9H0W9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
C11orf54Q9H0W9 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
C11orf54Q9H0W9 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
C11orf54Q9H0W9 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC23.54■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
C11orf54Q9H0W9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
C11orf54Q9H0W9 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
C11orf54Q9H0W9 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
C11orf54Q9H0W9 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
C11orf54Q9H0W9 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.2 ms