Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZW2

SLC13A1, Solute carrier family 13 member 1, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC13A1Q9BZW2 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SLC13A1Q9BZW2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SLC13A1Q9BZW2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.56■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.52■■■□□ 2
SLC13A1Q9BZW2 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
SLC13A1Q9BZW2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
SLC13A1Q9BZW2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
SLC13A1Q9BZW2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
SLC13A1Q9BZW2 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
SLC13A1Q9BZW2 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.19■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
SLC13A1Q9BZW2 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms