Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXP2

SLC12A9, Solute carrier family 12 member 9, humanhuman

Predictions only

Length 914 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC12A9Q9BXP2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A9Q9BXP2 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
SLC12A9Q9BXP2 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.88
SLC12A9Q9BXP2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
SLC12A9Q9BXP2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
SLC12A9Q9BXP2 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
SLC12A9Q9BXP2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
SLC12A9Q9BXP2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
SLC12A9Q9BXP2 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
SLC12A9Q9BXP2 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
SLC12A9Q9BXP2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
SLC12A9Q9BXP2 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms