Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXC9

BBS2, Bardet-Biedl syndrome 2 protein, humanhuman

Predictions only

Length 721 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BBS2Q9BXC9 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
BBS2Q9BXC9 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC28.03■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
BBS2Q9BXC9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.95■■■□□ 2.07
BBS2Q9BXC9 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.9■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
BBS2Q9BXC9 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
BBS2Q9BXC9 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
BBS2Q9BXC9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
BBS2Q9BXC9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
BBS2Q9BXC9 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
BBS2Q9BXC9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
BBS2Q9BXC9 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 124.2 ms