Protein–RNA interactions for Protein: Q9BRL7

SEC22C, Vesicle-trafficking protein SEC22c, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEC22CQ9BRL7 PPP2CB-204ENST00000518564 691 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SEC22CQ9BRL7 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
SEC22CQ9BRL7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.95■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
SEC22CQ9BRL7 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
SEC22CQ9BRL7 HOXB3-208ENST00000476342 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SEC22CQ9BRL7 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SEC22CQ9BRL7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 INO80B-201ENST00000233331 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
SEC22CQ9BRL7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CMTM4-202ENST00000394106 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CMTM4-204ENST00000563952 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
SEC22CQ9BRL7 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms