Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 TUBB6-201ENST00000317702 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.68■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC31.67■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.67■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC31.65■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.65■■■□□ 2.66
SLF1Q9BQI6 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC31.63■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 SAMD1-202ENST00000533683 2164 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC31.62■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
SLF1Q9BQI6 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC31.57■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC31.56■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC31.55■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.54■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC31.52■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC31.52■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.64
SLF1Q9BQI6 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.49■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.48■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC31.47■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.46■■■□□ 2.63
SLF1Q9BQI6 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.44■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SLF1Q9BQI6 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC31.36■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SLF1Q9BQI6 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC31.28■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.6
SLF1Q9BQI6 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.26■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.24■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.24■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.21■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC31.2■■■□□ 2.59
SLF1Q9BQI6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC31.2■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC31.18■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC31.17■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
SLF1Q9BQI6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.17■■■□□ 2.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms