Protein–RNA interactions for Protein: Q99986

VRK1, Serine/threonine-protein kinase VRK1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 396 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VRK1Q99986 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
VRK1Q99986 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
VRK1Q99986 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.35
VRK1Q99986 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC23.45■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
VRK1Q99986 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
VRK1Q99986 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
VRK1Q99986 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
VRK1Q99986 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms