Protein–RNA interactions for Protein: Q99748

NRTN, Neurturin, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRTNQ99748 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NRTNQ99748 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.33■■□□□ 1.81
NRTNQ99748 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.31■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
NRTNQ99748 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
NRTNQ99748 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NRTNQ99748 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.14■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.13■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC26.09■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NRTNQ99748 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NRTNQ99748 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
NRTNQ99748 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93 ms