Protein–RNA interactions for Protein: Q99062

CSF3R, Granulocyte colony-stimulating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 836 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSF3RQ99062 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CSF3RQ99062 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CSF3RQ99062 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CSF3RQ99062 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CSF3RQ99062 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CSF3RQ99062 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CSF3RQ99062 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.55■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CSF3RQ99062 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CSF3RQ99062 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
CSF3RQ99062 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms