Protein–RNA interactions for Protein: Q96SN8

CDK5RAP2, CDK5 regulatory subunit-associated protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,893 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDK5RAP2Q96SN8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.81
CDK5RAP2Q96SN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.54■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CDK5RAP2Q96SN8 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC32.5■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.47■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.46■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CDK5RAP2Q96SN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CDK5RAP2Q96SN8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CDK5RAP2Q96SN8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.28■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.26■■■□□ 2.76
CDK5RAP2Q96SN8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 SULT4A1-201ENST00000330884 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CDK5RAP2Q96SN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CDK5RAP2Q96SN8 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CDK5RAP2Q96SN8 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CDK5RAP2Q96SN8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CDK5RAP2Q96SN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CDK5RAP2Q96SN8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.13■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CDK5RAP2Q96SN8 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CDK5RAP2Q96SN8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK5RAP2Q96SN8 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CDK5RAP2Q96SN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CDK5RAP2Q96SN8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CDK5RAP2Q96SN8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.3 ms