Protein–RNA interactions for Protein: Q96P64

AGAP4, Arf-GAP with GTPase, ANK repeat and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AGAP4Q96P64 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 STK25-202ENST00000401869 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
AGAP4Q96P64 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 SDCCAG3-202ENST00000357365 2304 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
AGAP4Q96P64 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
AGAP4Q96P64 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
AGAP4Q96P64 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 KCNK1-202ENST00000366621 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
AGAP4Q96P64 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 DPP6-204ENST00000406326 2012 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
AGAP4Q96P64 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
AGAP4Q96P64 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
AGAP4Q96P64 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.2 ms