Protein–RNA interactions for Protein: Q96JQ2

CLMN, Calmin, humanhuman

Predictions only

Length 1,002 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLMNQ96JQ2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.5■■■□□ 2.79
CLMNQ96JQ2 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CLMNQ96JQ2 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLMNQ96JQ2 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CLMNQ96JQ2 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CLMNQ96JQ2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC32.38■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CLMNQ96JQ2 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CLMNQ96JQ2 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 FBRSL1-201ENST00000434748 5568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC32.24■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CLMNQ96JQ2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC32.17■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC32.17■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.15■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CLMNQ96JQ2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLMNQ96JQ2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CLMNQ96JQ2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CLMNQ96JQ2 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CLMNQ96JQ2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CLMNQ96JQ2 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CLMNQ96JQ2 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CLMNQ96JQ2 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CLMNQ96JQ2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC31.96■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC31.95■■■□□ 2.71
CLMNQ96JQ2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC31.94■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 FEZF2-201ENST00000283268 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CLMNQ96JQ2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC31.86■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC31.84■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 SERINC2-201ENST00000373709 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CLMNQ96JQ2 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CLMNQ96JQ2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC31.82■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28 ms