Protein–RNA interactions for Protein: Q96FQ7

LINC00526, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00526, humanhuman

Predictions only

Length 95 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00526Q96FQ7 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
LINC00526Q96FQ7 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
LINC00526Q96FQ7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
LINC00526Q96FQ7 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
LINC00526Q96FQ7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
LINC00526Q96FQ7 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LINC00526Q96FQ7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.7 ms