Protein–RNA interactions for Protein: Q96CN9

GCC1, GRIP and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCC1Q96CN9 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.97■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC33.96■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
GCC1Q96CN9 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC33.91■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC33.9■■■■□ 3.02
GCC1Q96CN9 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
GCC1Q96CN9 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.81■■■■□ 3
GCC1Q96CN9 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.79■■■■□ 3
GCC1Q96CN9 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC33.77■■■■□ 3
GCC1Q96CN9 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC33.75■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC33.74■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC33.74■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC33.73■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC33.72■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.7■■■□□ 2.99
GCC1Q96CN9 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.69■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC33.69■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC33.67■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
GCC1Q96CN9 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC33.63■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.61■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.58■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
GCC1Q96CN9 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC33.57■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC33.56■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC33.56■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
GCC1Q96CN9 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC33.48■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.46■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
GCC1Q96CN9 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC33.43■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC33.41■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.4■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
GCC1Q96CN9 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.38■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC33.37■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.34■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.33■■■□□ 2.93
GCC1Q96CN9 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC33.32■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC33.3■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.3■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC33.3■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.29■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC33.29■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.28■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC33.28■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.27■■■□□ 2.92
GCC1Q96CN9 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC33.27■■■□□ 2.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.8 ms