Protein–RNA interactions for Protein: Q92838

EDA, Ectodysplasin-A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EDAQ92838 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.55■■■□□ 2.16
EDAQ92838 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
EDAQ92838 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.53■■■□□ 2.16
EDAQ92838 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDAQ92838 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
EDAQ92838 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
EDAQ92838 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDAQ92838 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDAQ92838 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC28.5■■■□□ 2.15
EDAQ92838 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
EDAQ92838 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
EDAQ92838 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDAQ92838 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDAQ92838 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
EDAQ92838 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
EDAQ92838 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDAQ92838 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
EDAQ92838 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
EDAQ92838 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
EDAQ92838 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
EDAQ92838 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EDAQ92838 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
EDAQ92838 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
EDAQ92838 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDAQ92838 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
EDAQ92838 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDAQ92838 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
EDAQ92838 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDAQ92838 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
EDAQ92838 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
EDAQ92838 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDAQ92838 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
EDAQ92838 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
EDAQ92838 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDAQ92838 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
EDAQ92838 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
EDAQ92838 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
EDAQ92838 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDAQ92838 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
EDAQ92838 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
EDAQ92838 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDAQ92838 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
EDAQ92838 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDAQ92838 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.23■■■□□ 2.11
EDAQ92838 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDAQ92838 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
EDAQ92838 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDAQ92838 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDAQ92838 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
EDAQ92838 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
EDAQ92838 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.2■■■□□ 2.1
EDAQ92838 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDAQ92838 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDAQ92838 TRIP10-202ENST00000313285 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
EDAQ92838 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.17■■■□□ 2.1
EDAQ92838 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDAQ92838 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
EDAQ92838 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
EDAQ92838 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
EDAQ92838 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
EDAQ92838 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
EDAQ92838 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDAQ92838 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDAQ92838 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
EDAQ92838 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDAQ92838 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDAQ92838 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
EDAQ92838 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDAQ92838 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDAQ92838 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDAQ92838 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
EDAQ92838 PPP2CB-201ENST00000221138 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
EDAQ92838 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
EDAQ92838 TPRG1L-201ENST00000344579 2189 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDAQ92838 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDAQ92838 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDAQ92838 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
EDAQ92838 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDAQ92838 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDAQ92838 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDAQ92838 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
EDAQ92838 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
EDAQ92838 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDAQ92838 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDAQ92838 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
EDAQ92838 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDAQ92838 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.02■■■□□ 2.08
EDAQ92838 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
EDAQ92838 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDAQ92838 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
EDAQ92838 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
EDAQ92838 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
EDAQ92838 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28■■■□□ 2.07
EDAQ92838 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
EDAQ92838 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 6.9 ms