Protein–RNA interactions for Protein: Q92537

SUSD6, Sushi domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 303 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD6Q92537 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC28.89■■■□□ 2.22
SUSD6Q92537 TGIF1-202ENST00000343820 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
SUSD6Q92537 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.81■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
SUSD6Q92537 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD6Q92537 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
SUSD6Q92537 B4GALT2-203ENST00000372324 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD6Q92537 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SUSD6Q92537 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SUSD6Q92537 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MAPK3-201ENST00000263025 1861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SUSD6Q92537 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SUSD6Q92537 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SUSD6Q92537 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SUSD6Q92537 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 KIAA2013-203ENST00000616327 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.39■■■□□ 2.14
SUSD6Q92537 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
SUSD6Q92537 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.6 ms