Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXH2

JPH3, Junctophilin-3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 748 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JPH3Q8WXH2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
JPH3Q8WXH2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC26.42■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
JPH3Q8WXH2 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC26.36■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
JPH3Q8WXH2 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.32■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
JPH3Q8WXH2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.79
JPH3Q8WXH2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.15■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.15■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
JPH3Q8WXH2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC26.11■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.1■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
JPH3Q8WXH2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.04■■□□□ 1.76
JPH3Q8WXH2 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.4 ms