Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN8

ARAP3, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP3Q8WWN8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ARAP3Q8WWN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP3Q8WWN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.9 ms