Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWN8

ARAP3, Arf-GAP with Rho-GAP domain, ANK repeat and PH domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,544 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARAP3Q8WWN8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
ARAP3Q8WWN8 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.7■■■■■ 4.43
ARAP3Q8WWN8 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC42.69■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC42.68■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 CRIP2-201ENST00000329146 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC42.65■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC42.64■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.63■■■■■ 4.42
ARAP3Q8WWN8 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.62■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 ARTN-202ENST00000372359 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 B4GALT7-201ENST00000029410 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.6■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 AGAP1-204ENST00000409457 2165 ntTSL 1 (best) BASIC42.59■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 CTDNEP1-208ENST00000573600 1724 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.57■■■■■ 4.41
ARAP3Q8WWN8 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC42.56■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC42.52■■■■■ 4.4
ARAP3Q8WWN8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 SFRP5-201ENST00000266066 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
ARAP3Q8WWN8 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.44■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC42.42■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC42.41■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC42.4■■■■■ 4.38
ARAP3Q8WWN8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.36■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC42.33■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.32■■■■■ 4.37
ARAP3Q8WWN8 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.32■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC42.3■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 PABPN1-201ENST00000216727 2001 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.29■■■■■ 4.36
ARAP3Q8WWN8 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC42.25■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC42.23■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC42.22■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC42.2■■■■■ 4.35
ARAP3Q8WWN8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC42.19■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC42.18■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.15■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
ARAP3Q8WWN8 ADRA2C-201ENST00000330055 2129 ntAPPRIS P1 BASIC42.13■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC42.12■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC42.1■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 ACOT7-209ENST00000545482 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.09■■■■■ 4.33
ARAP3Q8WWN8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC42.06■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 RAB12-201ENST00000329286 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.06■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.05■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC42.04■■■■■ 4.32
ARAP3Q8WWN8 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC41.98■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC41.97■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 CSNK1E-205ENST00000405675 2127 ntTSL 5 BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.96■■■■■ 4.31
ARAP3Q8WWN8 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC41.92■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC41.9■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC41.89■■■■■ 4.3
ARAP3Q8WWN8 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC41.88■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC41.87■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.86■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC41.85■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC41.83■■■■■ 4.29
ARAP3Q8WWN8 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC41.83■■■■■ 4.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.4 ms