Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
TRUB1Q8WWH5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 SATB1-AS1-216ENST00000598149 1119 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 FAM89B-202ENST00000449319 1337 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
TRUB1Q8WWH5 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 AGTRAP-204ENST00000376637 1067 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 CMAS-201ENST00000229329 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
TRUB1Q8WWH5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
TRUB1Q8WWH5 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
TRUB1Q8WWH5 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 MSANTD3-203ENST00000395067 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
TRUB1Q8WWH5 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 SYNGR1-202ENST00000318801 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
TRUB1Q8WWH5 LINC01578-203ENST00000554669 578 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 PLPP2-203ENST00000434325 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
TRUB1Q8WWH5 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
TRUB1Q8WWH5 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms