Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVB6

CHTF18, Chromosome transmission fidelity protein 18 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHTF18Q8WVB6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHTF18Q8WVB6 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
CHTF18Q8WVB6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CHTF18Q8WVB6 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CHTF18Q8WVB6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHTF18Q8WVB6 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHTF18Q8WVB6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CHTF18Q8WVB6 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
CHTF18Q8WVB6 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHTF18Q8WVB6 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHTF18Q8WVB6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
CHTF18Q8WVB6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 66 ms