Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI35

PATJ, InaD-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,801 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PATJQ8NI35 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
PATJQ8NI35 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC28.72■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
PATJQ8NI35 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC28.64■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
PATJQ8NI35 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC28.59■■■□□ 2.17
PATJQ8NI35 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC28.57■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.55■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
PATJQ8NI35 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
PATJQ8NI35 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
PATJQ8NI35 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
PATJQ8NI35 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
PATJQ8NI35 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
PATJQ8NI35 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
PATJQ8NI35 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
PATJQ8NI35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.28■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
PATJQ8NI35 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.9 ms