Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI22

MCFD2, Multiple coagulation factor deficiency protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 146 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCFD2Q8NI22 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
MCFD2Q8NI22 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 FAM19A5-203ENST00000402357 1508 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 ANKRD60-201ENST00000457363 1038 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
MCFD2Q8NI22 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
MCFD2Q8NI22 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 AL136373.1-201ENST00000634804 1449 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 HRAS-203ENST00000397596 1100 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
MCFD2Q8NI22 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
MCFD2Q8NI22 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
MCFD2Q8NI22 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
MCFD2Q8NI22 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
MCFD2Q8NI22 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms