Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
C17orf47Q8NEP4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf47Q8NEP4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf47Q8NEP4 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
C17orf47Q8NEP4 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC25.15■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
C17orf47Q8NEP4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
C17orf47Q8NEP4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
C17orf47Q8NEP4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
C17orf47Q8NEP4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
C17orf47Q8NEP4 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
C17orf47Q8NEP4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
C17orf47Q8NEP4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
C17orf47Q8NEP4 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms