Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK8

FAM46D, Putative nucleotidyltransferase FAM46D, humanhuman

Predictions only

Length 389 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM46DQ8NEK8 SH3GLB2-201ENST00000372554 1985 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 CHST12-204ENST00000618655 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 C7orf50-202ENST00000397098 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.64■■□□□ 1.86
FAM46DQ8NEK8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
FAM46DQ8NEK8 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
FAM46DQ8NEK8 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
FAM46DQ8NEK8 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FAM46DQ8NEK8 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FAM46DQ8NEK8 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.3■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FAM46DQ8NEK8 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
FAM46DQ8NEK8 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms