Protein–RNA interactions for Protein: Q8N8W4

PNPLA1, Patatin-like phospholipase domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PNPLA1Q8N8W4 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
PNPLA1Q8N8W4 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
PNPLA1Q8N8W4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 RSG1-201ENST00000375599 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
PNPLA1Q8N8W4 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.39■■□□□ 1.98
PNPLA1Q8N8W4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC27.37■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
PNPLA1Q8N8W4 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
PNPLA1Q8N8W4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
PNPLA1Q8N8W4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
PNPLA1Q8N8W4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
PNPLA1Q8N8W4 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms