Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4Y2

CRACR2B, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 399 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2BQ8N4Y2 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC32.48■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 SMARCD3-201ENST00000262188 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
CRACR2BQ8N4Y2 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.41■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC32.41■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 CTDNEP1-201ENST00000318988 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CRACR2BQ8N4Y2 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CRACR2BQ8N4Y2 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC32.29■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
CRACR2BQ8N4Y2 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC32.25■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CRACR2BQ8N4Y2 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC32.16■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CRACR2BQ8N4Y2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC32.12■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.11■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC32.08■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CRACR2BQ8N4Y2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
CRACR2BQ8N4Y2 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.96■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.71
CRACR2BQ8N4Y2 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC31.95■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CRACR2BQ8N4Y2 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 123.5 ms