Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0W4

NLGN4X, Neuroligin-4, X-linked, humanhuman

Predictions only

Length 816 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLGN4XQ8N0W4 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC26.18■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
NLGN4XQ8N0W4 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 ANXA5-201ENST00000296511 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 IL1R1-201ENST00000409288 1735 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
NLGN4XQ8N0W4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC26.03■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
NLGN4XQ8N0W4 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
NLGN4XQ8N0W4 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC25.95■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 SH3BP2-221ENST00000511747 2351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
NLGN4XQ8N0W4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 CCZ1-201ENST00000325974 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 KCTD17-201ENST00000402077 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 CBLN1-201ENST00000219197 2435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
NLGN4XQ8N0W4 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 TWIST1-201ENST00000242261 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
NLGN4XQ8N0W4 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
NLGN4XQ8N0W4 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.2 ms