Protein–RNA interactions for Protein: Q8N0U6

LINC00518, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00518, humanhuman

Predictions only

Length 118 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00518Q8N0U6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
LINC00518Q8N0U6 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 HAPLN2-201ENST00000255039 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 FAM149A-215ENST00000514153 2070 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
LINC00518Q8N0U6 CTDNEP1-210ENST00000574322 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 AKR1E2-201ENST00000298375 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 CAPNS1-206ENST00000588815 1471 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
LINC00518Q8N0U6 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 CCM2-219ENST00000544363 1620 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 AES-202ENST00000327141 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
LINC00518Q8N0U6 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 LMO2-202ENST00000395833 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LINC00518Q8N0U6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.14■□□□□ 0.98
LINC00518Q8N0U6 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
LINC00518Q8N0U6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms