Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWX8

CHERP, Calcium homeostasis endoplasmic reticulum protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 916 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHERPQ8IWX8 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.91■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CHERPQ8IWX8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 RAB43-207ENST00000476465 1627 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CHERPQ8IWX8 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 PPP1R1A-201ENST00000257905 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CHERPQ8IWX8 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 BRF1-213ENST00000548421 1452 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CHERPQ8IWX8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
CHERPQ8IWX8 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 HNRNPAB-207ENST00000514633 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC25.61■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC25.6■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 CYP26C1-201ENST00000285949 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
CHERPQ8IWX8 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 MVK-208ENST00000539696 608 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.68
CHERPQ8IWX8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CHERPQ8IWX8 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 MAPK1-202ENST00000398822 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CHERPQ8IWX8 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms