Protein–RNA interactions for Protein: Q86W25

NLRP13, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 13, humanhuman

Predictions only

Length 1,043 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP13Q86W25 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.85■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.84■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC37.83■■■■□ 3.65
NLRP13Q86W25 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.82■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 VPS37D-201ENST00000324941 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.81■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.8■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 RASGEF1C-207ENST00000615330 2268 ntTSL 5 BASIC37.79■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SLC22A23-201ENST00000380298 1574 ntTSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 SDCCAG3-204ENST00000371725 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.78■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.76■■■■□ 3.64
NLRP13Q86W25 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.76■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.75■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC37.74■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 FMR1-219ENST00000621453 1864 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC37.73■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 MAPK4-202ENST00000540640 1576 ntTSL 2 BASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC37.72■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 BRF1-221ENST00000619151 1530 ntTSL 5 BASIC37.71■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 ADRA2C-202ENST00000509482 1600 ntTSL 3 BASIC37.7■■■■□ 3.63
NLRP13Q86W25 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC37.68■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.67■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC37.66■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC37.65■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 RNF215-203ENST00000382363 1992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC37.64■■■■□ 3.62
NLRP13Q86W25 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC37.63■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 INPP5A-202ENST00000368593 1432 ntTSL 1 (best) BASIC37.62■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC37.61■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC37.6■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC37.58■■■■□ 3.61
NLRP13Q86W25 PVT1-219ENST00000523427 938 ntTSL 3 BASIC37.57■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC37.56■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ANGPTL6-204ENST00000592641 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.55■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC37.53■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 CCM2-201ENST00000258781 1894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.52■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.51■■■■□ 3.6
NLRP13Q86W25 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC37.5■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC37.48■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC37.47■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 POU3F1-201ENST00000373012 2184 ntAPPRIS P1 BASIC37.46■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC37.45■■■■□ 3.59
NLRP13Q86W25 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC37.44■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC37.41■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC37.4■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.39■■■■□ 3.58
NLRP13Q86W25 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC37.38■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 SSU72-201ENST00000291386 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC37.37■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC37.36■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.34■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC37.33■■■■□ 3.57
NLRP13Q86W25 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC37.31■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.3■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC37.29■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.28■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC37.27■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.27■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.26■■■■□ 3.56
NLRP13Q86W25 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.25■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 NIT1-201ENST00000368007 1749 ntTSL 2 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.24■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC37.23■■■■□ 3.55
NLRP13Q86W25 CACNG6-201ENST00000252729 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC37.22■■■■□ 3.55
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms