Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z3B0

SMIM15, Small integral membrane protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM15Q7Z3B0 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 GNB5-202ENST00000358784 1735 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 LTB4R2-204ENST00000533293 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 AL357033.3-201ENST00000620143 614 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
SMIM15Q7Z3B0 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 ZBTB12-201ENST00000375527 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
SMIM15Q7Z3B0 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 INO80B-203ENST00000409917 796 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 CCM2-218ENST00000541586 1719 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 FAM89B-203ENST00000530349 1263 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
SMIM15Q7Z3B0 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 AC015813.7-201ENST00000623294 581 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 AC120057.4-201ENST00000624722 1615 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 NFKBIA-209ENST00000557389 1537 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 AC105285.1-201ENST00000500914 2036 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 SLC2A4RG-201ENST00000266077 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 LY6K-202ENST00000518841 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 TRAPPC10-202ENST00000380221 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
SMIM15Q7Z3B0 JUND-201ENST00000252818 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 BMP7-202ENST00000395864 1746 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
SMIM15Q7Z3B0 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 DEXI-201ENST00000331808 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SMIM15Q7Z3B0 HOXB3-207ENST00000472863 1909 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.2 ms